San Jose Sharks piti tiedoitustilaisuuden koskien Jevgeni Nabokovia ja hänen pelaajauransa päätöstä. Maalivahti kertoi 697 NHL-peliä kestäneen uransa olevan päätöksessä ja kiitteli San Joseta siitä, että he hankkivat hänet vielä seuraan, jossa hän pelasi suurimman ajan urastaan. Nabokovhan siirtyi 9.2 tehdyssä muodollisessa treidissä Tampa Bay Lightningista kun kävi selväksi, että hän aikoo lopettaa uransa. Hän kertoi että varsinaista estettä ei peliuran jatkumiselle ollut, mutta totesi ajan päätökselle olevan kypsä. Nabokov pelasi San Josen riveissä kymmenen kautta vuosien 1999-2009 aikana ja johtaa Sharksin sisäistä maalivahtitilastoa monessa sarakkeessa, kuten nollapeleissä joita kertyi tuona aikana 50 kpl.
Tuon jälkeen hän pelasi yhden kauden KHL:ssä SKA Pietarin riveissä, kunnes tuli takaisin NHL:ään 2011 tehden sopimuksen Detroitiin, mutta päätyi Waiwers-kierroksen jälkeen Islandersiin, jossa hän ensin kieltäytyi pelaamasta. Kuluvalla kaudella Nabokov pelasi vielä 11 ottelua Lightningin maalilla, mutta enemmänkin hänen tehtävänään oli mentoroida nuorta maalivahtilupaus Andrei Vasilevkiä. Hän pelasi myös useissa arvokisoissa Venäjän maajoukkueessa. Ainoa asia joka Nabokovia jäi omien sanojensa mukaan kaivamaan urallaan oli se, ettei hän koskaan voittanut Stanley Cup-pokaalia urallaan.